Территориальный орган Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения по Липецкой области образован в 2006 году.
Структура федеральных органов исполнительной власти утверждена Указом Президента Российской Федерации № 649 от 20 мая 2004 года. Положение о Федеральной службе по надзору в сфере здравоохранения утверждено Постановлением Правительства Российской Федерации № 323 от 30 июня 2004 года. Приказом Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения и социального развития от 22 ноября 2011 года № 7623-Пр/11 было утверждено Положение о территориальном органе Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения и социального развития по Липецкой области (Управление Росздравнадзора по Липецкой области). Приказом Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения от 13 июля 2012 года № 129-Пр/12 были внесены изменения в приказ Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения и социального развития от 22 ноября 2011 года № 7623-Пр/11 "Об утверждении Положения о территориальном органе Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения и социального развития по Липецкой области (Управление Росздравнадзора по Липецкой области)». Приказом Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения от 06 июня 2013 года № 2328-Пр/13 утверждено новое Положение о территориальном органе Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения по Липецкой области.
На сегодняшний день штатная численность Территориального органа Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения по Липецкой области составляет 10 единиц. Штат укомплектован на семь единиц.
Основными полномочиями Территориального органа Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения по Липецкой области являются контроль и надзор в сфере здравоохранения, а также лицензирование медицинской и фармацевтической деятельности.
